Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD51Q06609 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD51Q06609 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms