Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms