Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms