Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CHRNB3Q05901 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CHRNB3Q05901 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms