Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PTPN12Q05209 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms