Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
COG7P83436 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
COG7P83436 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COG7P83436 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
COG7P83436 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
COG7P83436 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms