Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SIM1P81133 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms