Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SKP1P63208 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SKP1P63208 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SKP1P63208 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SKP1P63208 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms