Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMSP52788 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMSP52788 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SMSP52788 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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