Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IDH3AP50213 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms