Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF6P49848 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TAF6P49848 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms