Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRPC1P48995 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms