Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI2P48788 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms