Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RECQLP46063 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RECQLP46063 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms