Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TSFMP43897 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TSFMP43897 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TSFMP43897 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms