Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LTBRP36941 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LTBRP36941 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LTBRP36941 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms