Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GJC1P36383 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms