Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OTX2P32243 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OTX2P32243 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms