Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTPRDP23468 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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