Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FGFR4P22455 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FGFR4P22455 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms