Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD247P20963 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD247P20963 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD247P20963 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms