Protein–RNA interactions for Protein: P20231

TPSB2, Tryptase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPSB2P20231 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TPSB2P20231 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms