Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDH1P12830 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH1P12830 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms