Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RLBP1P12271 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms