Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TPRP12270 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TPRP12270 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TPRP12270 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRP12270 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRP12270 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRP12270 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRP12270 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TPRP12270 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms