Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
VPREB1P12018 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms