Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GLI2P10070 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLI2P10070 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLI2P10070 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLI2P10070 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GLI2P10070 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms