Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM58BPP0C7Q3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms