Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms