Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms