Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF839A8K0R7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms