Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARID3CA6NKF2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARID3CA6NKF2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms