Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC12A4Q9UP95 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms