Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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USP18Q9UMW8 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP18Q9UMW8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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