Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LHX3Q9UBR4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LHX3Q9UBR4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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