Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DKK3Q9UBP4 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms