Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
USP36Q9P275 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
USP36Q9P275 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms