Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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