Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms