Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
USP29Q9HBJ7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms