Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF17Q9BXT8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms