Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP2Q9BX26 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms