Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC94Q9BW85 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms