Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HIGD2AQ9BW72 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms