Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUP58Q9BVL2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms