Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHOXF2Q9BQY4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms