Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMCHL2Q9BQD1 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms