Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NPAS2Q99743 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms