Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
JSRP1Q96MG2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
JSRP1Q96MG2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms