Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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